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養(yǎng)豬業(yè)是我國畜牧業(yè)的支柱產(chǎn)業(yè)，培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗病的優(yōu)良種豬是實現(xiàn)我國養(yǎng)豬業(yè)可持續(xù)發(fā)展的根本保障。近年來，我國在豬生長、肉質(zhì)和抗病性狀的功能基因組研究領(lǐng)域取得了一批具有國際影響力的成果，但在豬重要經(jīng)濟性狀的功能基因分離與鑒定、基因網(wǎng)絡(luò)調(diào)控、功能基因組學(xué)平臺構(gòu)建等方面還較欠缺，不能滿足我國豬品種改良及豬分子設(shè)計育種的需求。2013年，863計劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域啟動了“豬重要經(jīng)濟性狀的功能基因組學(xué)研究”課題。2015年7月17日，科技部組織有關(guān)專家對該課題進行了中期檢查。

“豬重要經(jīng)濟性狀的功能基因組學(xué)研究”課題啟動以來，課題組針對我國養(yǎng)豬業(yè)的可持續(xù)發(fā)展對功能基因組學(xué)新成果、新技術(shù)的戰(zhàn)略性需求，以生長、肉質(zhì)、抗病等性狀進行功能基因組學(xué)解析、豬大規(guī)模突變品系的創(chuàng)建等為重點研究內(nèi)容，完成了超過2000頭豬不同性狀測定數(shù)據(jù)的收集，并完成了榮昌豬、藏豬等20多個中國地方豬種的基因組（重）測序工作。通過數(shù)據(jù)分析，課題組鑒定出了在不同豬種中受選擇的區(qū)域或基因，基于藏豬的基因組測序分析揭示出藏豬特殊環(huán)境適應(yīng)性進化的組學(xué)機制，相關(guān)研究成果在國際知名期刊NatureGenetics的發(fā)表。同時，課題組選用piggyBac轉(zhuǎn)座子載體pZG，將pZG質(zhì)粒和pCAG-4PB-ineo質(zhì)粒共同電轉(zhuǎn)并進行流式分選GFP陽性細(xì)胞作為供體，獲得了pZG陽性豬和健康的pCAG-4PB-ineo轉(zhuǎn)基因豬，創(chuàng)建了piggyBac轉(zhuǎn)基因突變豬新材料。該方法被證明是實現(xiàn)高效、簡便、低成本的豬規(guī)模化基因突變的有效途徑，將極大的促進家畜育種及醫(yī)學(xué)新藥的發(fā)展。

中期檢查專家組認(rèn)為，經(jīng)過兩年多的研究，“豬重要經(jīng)濟性狀的功能基因組學(xué)研究”課題組在豬功能基因組學(xué)研究工具與平臺完善、豬基因組結(jié)構(gòu)解析及生長、肉質(zhì)等經(jīng)濟性狀組學(xué)解析方面取得了較大進展，對實現(xiàn)我國動物育種重大理論和關(guān)鍵技術(shù)突破，提高我國豬功能基因組研究水平和自主創(chuàng)新能力具有重要的現(xiàn)實意義。